4、专用肥料价格偏高。水肥一体化技术对肥料的溶解度要求较高，目前滴灌专用肥价格较高、品种偏少、针对性差。 

　　5、政府财政投入不足。各地用于农田水利等基础设施投入较多，而且多数设施与微灌、喷灌等高效节水不配套，政府、农民和社会等各方面的积极性还没有充分调动起来。在小麦、玉米等粮食作物上的应用才刚起步。