以上的基本假定，确定了作物数字模型是一个可以通用的基本模型，其它类型的作物都可以纳入其模型之中进行分析计算。

植物的生理年龄由发育阶段（程序中采用首字母缩写：DVS 的状态量）决定，而发育阶段又以各种器官的形成及其外观为特征。对于谷类作物，最重要的物候变化是从营养期到生殖期的物候变化，这决定了器官干物质分配的最重要变化。其他作物，如甜菜、土豆或豆类，在不同作物器官的外观上有更为渐进性的变化。

同化物分布在不同的植物器官上(叶、茎、根、贮藏器官)取决于生长阶段DVS，WOFOST中的多数作物分成两阶段划分：地下分配比例如根( FRTB )和地面上分配比例 ( 1–FRTB ) 。

作物（土豆）生长阶段DVS函数的比例分配图见下图：

由于DVS会改变许多生理和形态过程，因此在任何作物生长模拟模型中，物候发育的准确定量都是至关重要的。在WOFOST中，发育阶段表示为无量纲变量，播种时值为-0.1，出苗时值为0，开花时值为1，成熟时值为2。

这种物候发育的方法对于谷物作物是典型的，所有其他作物都被通过这个假定采用这种发育模式，方便于建立作物的通用模型。这也意味着DVS=1不一定对应于开花生育激发的阶段，而是指示储存或生殖器官形成的开始。例如，对于马铃薯或根作物的模拟，DVS=1 只是表示块茎或根开始生长的时刻，而不是其开花的时刻。

近年来，BBCH规模(https://en.wikipedia.org/wiki/BBCH-scale)是为了提供一个框架来定义各种作物的生育期。WOFOST使用的物候阶段大致对应于BBCH等级0（播种）、1（叶片发育）、6（开花）和9（衰老）。将WOFOST的内部算法转换为使用BBCH量表进行物候学并非易事，因为许多WOFOST参数被定义为DVS的函数。然而，在校准研究中证明，特定的DVS值可以始终与特定的BBCH阶段相关联。尽管作物达到特定BBCH阶段的确切DVS值可能由于不同品种的数值不一样。

随着生长季节的开始，播种或出苗的日期可能会有所不同。对于像WOFOST这样的光合作用驱动模型，作物生长的模拟从出苗开始。如果播种日期由模型用户选择，则出苗日期由模型确定。作物出苗可定义为自播种日期起的有效日温度总和的函数。当有效日温度总和达到出现阈值温度（缩写：TSUMEM）时出现。该阈值的温度是作物特有的，应由当地用户具体给出。每日有效温度取决于基本温度TBASEM，低于该温度时不会发生发芽过程，最高每日温度为发芽活性不再增加的TEFFMX。两者都是作物特有的。